O Departamento de Física (DF), formalmente criado em 1986, foi pioneiro em Portugal no ensino da Engenharia Física. Actualmente, o DF desenvolve as suas actividades de ensino (1º, 2º e 3º ciclos), de investigação fundamental e aplicada e de desenvolvimento tecnológico nos domínios da Física, da Engenharia Física e da Engenharia Biomédica. Está ainda vocacionado para a prestação de serviços e para a divulgação científica nestes domínios.
A atividade científica do DF desenvolve-se essencialmente em duas Unidades de Investigação, o LIBPhys-UNL e o CEFITEC. A investigação abrange diversas áreas, tais como física atómica e molecular, física nuclear e dos plasmas, física das superfícies e interfaces, tecnologia laser e de vácuo, instrumentação, técnicas analíticas aplicadas à saúde e património cultural, instrumentação médica, imagem médica, aprendizagem automática, biossinais e engenharia de tecidos.